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最佳反应范围取决于菌株，但一般来说，硝化菌最佳反应范围为pH 6.5-8.0，而反硝化菌最佳反应范围为pH 7.0-9.0，在此范围内，硝化菌和反硝化菌活性最高。
硝化细菌作用，主要是净化水质，去除水中异味，保持水质稳定和干净明亮。在使用过程，一些水族玩家会同时使用水质稳定剂（硫代硫酸钠）一起使用，这个作用也是去除水中氯和氨重金属等因子，去除水中腥臭味，抑制有害菌，巩固水体生态系统，配合硝化细菌使用，使水质干净明亮。
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