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硝化细菌水温5摄氏度到42摄氏度之间可以存活，在温度低于5℃或高于42℃时，硝化作用已经无法进行。
硝化细菌广泛存在于自然环境中。其存活需要水分及氧气，只有同时满足水分与氧气的供应才能存活。在泥土、沙粒、生化棉、生化球、玻璃环、陶瓷环等各种有微孔的滤材中更宜于大量繁殖。
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