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硝化菌属于一种好氧自养菌，包括了亚硝酸菌和硝酸菌。硝化菌主要的功能是分解氨，当鱼缸里的有机物分解后会产生对鱼有剧毒的氨，这时亚硝酸菌就会将其分解为亚硝酸盐，然后再有硝酸菌将亚硝酸盐转化为对鱼无害硝酸盐。
硝化菌是可以自然产生的，但由于它是自养菌，所以它的繁殖会比较慢，按照正常培养的话差不多要1-2个月才能建立硝化系统，因为硝化系统的建立可不是一个两个菌就能完成的。
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