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鱼缸硝化细菌可以转化水中的氨氮，将其变为亚硝酸盐，并进一步变为硝酸盐，这样就可以改善水质，还可以保持水质清洁。同时产生的物质还能作为水生植物的养分。
此外，鱼缸内有很多的微生物和细菌，硝化细菌本身也可以维持水中的生态平衡。如果要培养硝化细菌的话，每周需要倒入适量的培养液，之后要关灯爆氧一段时间，促进它的生长繁殖，等到水体浑浊又清澈后，硝化系统就已经建立完成。
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