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这两种不是同一个菌种。硝化细菌的意思是利用含氮化合物，比方说氨，亚硝酸之类的氧化提供能量的自养细菌。固氮细菌是能把空气中的氮气转化为氨的细菌。
另外，硝化细菌分为硝酸菌和亚硝酸菌，均为专性好氧菌。固氮细菌是对所有能够进行生物固氮的原核生物的统称，其对氧的需求型有多种，包括好氧，兼性厌氧，专性厌氧。
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