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硝化细菌的硝化作用属于化能合成的范畴，硝化作用本质上是把氨转变为硝酸盐。硝化细菌分为2类，即亚硝化细菌（氨氧化细菌）和硝化细菌（亚硝酸盐氧化细菌）。
亚硝酸细菌（又称氨氧化菌），将氨氧化成亚硝酸。硝酸细菌（又称亚硝酸氧化菌），将亚硝酸氧化成硝酸。氨和亚硝酸在水中达到一定的含量对鱼有害，硝化细菌的作用就是使氨和亚硝酸转化成硝酸，硝酸可以和水中的金属离子结合成硝酸盐，能够被水中藻类或者植物所吸收，形成良性循环，有利于水质的净化，使水质保持稳定，鱼儿不容易得病。
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