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硝化细菌通常用于处理污水，以减少氨氮含量。它们可以用来催化氨氮的氧化反应，将氨氮转化为无害的氮气和水。硝化细菌也可以用于处理污染物，如水中的有机物，以减少水中的悬浮物。
硝化细菌倒入鱼缸内，先给它充分的摇匀按照每10ml硝化细菌用于70l水的量硝化细菌。新鱼缸开缸时候，先放入几只闯缸鱼，然后按上面操作倒入鱼缸中，以7天的周期，再倒入鱼缸水体比例的硝化细菌液，水体中的硝化细菌系统稳定建立后，水质干净且透亮，水体没有发白。
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