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海蚯蚓保存需构建微型海洋生态系统。短期保存（3-5天）可采用海水循环法，使用气泵维持溶氧量在5mg/L以上，每日更换10%海水以保持水质。长期保存需模拟潮间带环境，将海蚯蚓与底栖硅藻共养，通过LED灯光模拟日照周期。某水产研究所实验显示，此法可使存活率提升至85%。
商业化保存采用两阶段法：前期用海水晶配置人工海水，盐度控制在28-32‰，后期转入含有益生菌的保存液，可延长保鲜期至15天。家庭保存建议使用海水素颗粒，按1:30比例与淡水混合，容器加盖但留透气孔。需注意避免金属容器，其释放的铁离子会破坏海蚯蚓体表黏液。
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