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尽管金龟子是最常见的昆虫类群之一，部分特有品种正面临濒危威胁，主要原因包括栖息地破坏、环境污染和过度采集。热带雨林的砍伐导致大王花金龟等珍稀品种失去生存空间，其幼虫依赖的腐殖质环境被破坏，种群数量十年下降 70%；农业区的农药滥用，直接毒害金龟子幼虫和成虫，导致农田周边金龟子种类减少 50% 以上。
过度采集用于宠物贸易和标本收藏，加剧了濒危进程，如非洲的彩虹蜣螂因艳丽外表被过度捕捉，已被列入 IUCN 红色名录。气候变化的影响也逐渐显现，温度升高改变金龟子的繁殖周期，降雨模式变化影响其食物资源，如干旱导致粪便减少，腐食性金龟子面临食物危机。
保护措施包括建立自然保护区、推广有机农业减少农药使用、开展人工繁育项目。例如，马达加斯加设立的金龟子保护区，有效保护了当地 23 种特有金龟子；日本的独角仙人工繁殖技术成熟，减少了野外捕捉压力。
金龟子的保护不仅是物种存续问题，更是生态系统健康的重要指标，需引起更多关注。
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