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当前全球仍有约2200种萤火虫存活，但种群数量呈显著下降趋势。中国境内已知140余种，其中11种被列入《有重要生态、科学、社会价值的陆生野生动物名录》（“三有”名录），如三叶虫萤、红胸黑翅萤等。尽管未被列为国家保护动物，但部分种类如香港分布的郑凯甄怪眼萤已处于极度濒危状态。
种群减少的主因包括：
栖息地丧失：城市化进程导致湿地、池塘等生境破坏，直接减少成虫产卵地；
光污染：人工光源干扰荧光信号，阻碍交配行为；
化学污染：生活污水、农药残留破坏水生幼虫生存环境；
过度采集：旅游开发中的游客踩踏及商业捕捉行为。
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