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蛔虫成虫的主要寄生部位是人体小肠，尤其是空肠和回肠上段。这一选择与小肠的生理环境密切相关：小肠内pH值接近中性，肠黏膜分泌的黏液为蛔虫提供保护层，同时丰富的营养物质（如葡萄糖、氨基酸）满足虫体生长需求。雌虫每日可产卵20万枚，虫卵随粪便排出体外，在土壤中发育为感染性虫卵后，通过污染食物或水源重新进入人体。
蛔虫具有“钻孔”习性，当肠道环境改变（如发热、腹泻、驱虫药刺激）时，成虫可能移行至其他部位。约10%的感染者会出现异位寄生：虫体可钻入胆总管引发胆绞痛，或进入阑尾导致炎症，甚至通过胰管进入胰腺引发急性胰腺炎。极少数情况下，蛔虫可通过血液循环到达肺部、肝脏或脑部，造成严重损害。这种寄生部位的多样性，使得蛔虫感染的临床表现复杂多变，需通过粪便检查、超声或内镜等手段明确诊断。
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