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乌龟水霉病具备传染性，水霉菌孢子可以通过水体快速扩散到整个饲养环境。病龟体表脱落的菌丝、孢子漂浮在水里，同缸其他乌龟如果体表存在伤口，孢子就会附着感染。健康无伤口的乌龟有一定抵抗力，感染概率偏低，但不能完全排除风险，环境真菌浓度高时感染可能性会上升。
发现水霉病之后，必须立刻把病龟单独隔离饲养，原饲养缸全面换水，缸体、晒台做消毒处理。隔离饲养期间，病龟使用单独的工具，不要和健康龟的捞网、容器混用，防止孢子交叉携带。病龟痊愈之后，也不要马上放回原缸，需要观察一段时间，确认体表没有菌丝，再评估合缸，避免反复爆发水霉。
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