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仓鼠能携带的病毒较少，但是所能携带的病原微生物较多，包括仓鼠在内的很多啮齿动物都携带有很多感染力极强的病菌、病毒、病原微生物。当然有但是不限于真菌、鼠疫、出血热、猩红热、登革热、斑疹伤寒、霍乱、跳蚤、虱子等。但是我们平时饲养的仓鼠感染以上疾病的可能性较少，所以只要用心饲养，保证生活环境，一般是没有太大问题的。
仓鼠身上会有一些细菌，寄生虫之类的，这也是很正常的，不需要担心，因为家养的仓鼠，不会轻易的传染给人，所以平时多给它们清理小窝，做看驱虫的工作，就可以了。
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