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从基因遗传上来说，苏格兰折耳猫咪一定会表现出来先天性软骨发育不良综合症，只是发病的时间，程度不一。再加上猫咪忍疼能力强，只有到较为严重的时候才会被发现。
把折耳的软骨发育不良基因称为A，为显性遗传，正常的立耳基因为a，为隐性遗传。含AA或Aa基因的折耳猫咪一定会发病，而含aa基因的折耳猫咪不发病，但也不表现折耳这个外在形象。
总而言之就是外在表现折耳基因里一定含有A基因，一定伴随软骨发育不良，而外在不表现折耳基因一定是纯合子aa，也不会有软骨发育不良。
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