侏儒龟是非洲侧颈龟属最小的龟种。背甲棕色，点缀着模糊的深褐色条纹斑点等图案。从侧面看去背甲较为扁平，甲板后缘呈锯齿状。腹甲黄色，外圈黑色，有一道不算发达的铰链结构。不能完全闭合，铰链前叶的甲板很长。侏儒侧颈龟鼻尖圆而钝，头部稍小，较厚。头顶部呈灰色，它包含深褐色的虫纹斑。下颚处有两个短小的胡须。
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