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卡罗莱纳箱龟是由卡尔·林奈在1758年首次描述的。它是箱龟属的模式种，其亚种数量是该属下最多的，而其中最常见的则是东部箱龟，亦是由林奈描述。直到19世纪时，其他5个亚种才被分到该种下。此外还有一个灭绝种。
卡罗莱纳箱龟由于各种人类会动的威胁，其数量正在不断下降。农业化及都市化破坏了他们的栖息地，经常有卡罗莱纳箱龟被发现碾死在高速公路上，国际宠物贸易也造成了一定影响。同时其生活习性使得其特别容易受到威胁。
卡罗莱纳箱龟一般为昼行夜伏，于清晨及雨后较活跃。本种属杂食性龟类，可以给它们吃小鱼、小虾在内的各种动物性饵料，也吃仙人掌、芦荟、各种水果等植种动物性饵料，也吃仙人掌、芦荟、各种水果等植物性饵料。其中佛罗里达亚种偏植食性。冬季，卡罗莱纳箱龟会进入冬眠，在习性上，本种与亚洲出产的黄缘闭壳龟有许多相似的地方。
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