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是的，金头闭壳龟是濒危物种，在《濒危物种国际贸易公约》中列为保护动物。
金头闭壳龟是保护动物，金头闭壳龟的野生自然资源极为稀少，截至2007年，据估计，全中国野外生存及家庭饲养的总数可能不超过1000只。
金头闭壳龟生态环境受协因素主要有：植物群落结构遭到破坏，主要表现为天然林和次生林常遭砍伐，山体滑坡，部分区域栖息地居民在溪流出水口私自接饮用水管道，造成旱季间歇式断流;受人工建筑需求，大量沙地被取掘;溪流水体环境趋向恶化，有大量生活用水流入，垃圾随意倾倒;人为肆意盗猎行为一直存在;支流河道均有与工、农业生产用水倾注，汀溪河段过度旅游开发(出现各类时尚的人工漂流游等);支流河道存在多道人工拦河坝、水电站、造纸厂;支流河道内人为张捕鱼虾。有诸多受协因子，应为导致与青弋江相通的漕溪河、孤峰河、汀溪河、清溪河的主河道内金头闭壳龟基本无生存条件的重要因素。
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