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黄缘闭壳龟野生个体发病极少，仅见有寄生虫病和狗捕捉时造成的外伤（因黄缘闭壳龟有特殊的香味，所以大别山区有人用训练有素的狗捕捉），人工养殖偶有传染病例发生。
1、寄生虫病 龟虱吸附在龟的四肢、腋下、颈部的皮肤上，直接吸取血液，影响食欲和休息，导致龟体消瘦，抵抗力下降。因此，放养时要药浴。
2、肠炎病 病龟反应迟钝，食欲下降或不食，初期粪便稀软不成型，严重时腹泻，便液带血色并有恶臭味。本病由饵料不适口、温度剧变导致消化机能紊乱引起。应科学投饵并酌情投放抗生素治疗。
3、烂甲病 病龟腹甲角质层脱落，少数个体轻微发炎并溃烂，主要是龟甲长时间与硬化的水泥池底面摩擦所致。对于有炎症的个体，可用1%的高锰酸钾溶液或碘酒擦洗溃烂部位，2～3次即可消除炎症。
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