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大狗比小狗老得更快之谜有新解:跳跃基因 LINE1 失控或为主因

在哺乳动物中,体型越大的物种通常寿命越长,从小鼠的仅仅几年,到某些鲸类接近 200 年。

可一旦观察同一物种内部,却常常看到相反的现象:较小的个体比更大的个体更长寿。狗身上就是这样。

爱狗的人和狗主人们长久以来都体会到这个例外:大型犬种往往比小型犬长得更快、更早离世。科学家一直想弄清这些狗年背后的原因,它缩短了狗和人类伴侣共度的时光。

该研究通讯作者、亚利桑那州立大学生命科学学院与演化与医学中心教授 Noah Snyder-Mackler 说,狗为理解衰老提供了一个很好的模型,因为它们在同一物种内部却展现出巨大的寿命差异。

大型犬不仅更短寿,还更容易患上多种与年龄相关的疾病。科学家在犬类衰老方面所学到的,也能帮助理解人类衰老。

Snyder-Mackler 说,因为它们是我们的伴侣动物,它们也能成为一种和人类健康当下就相关的有效模型。和我们共同生活,意味着我们共享经历与环境;我们对宠物的爱,意味着我们为其提供食物、运动与终身健康照护。所以我们可以把许多在较短寿的宠物身上获得的发现转化到人类。

由亚利桑那州立大学研究人员主导的一项新研究,第一次为何其大型犬寿命更短提供了有说服力的分子解释:答案可能在于衰老标志如何重塑犬类 DNA。研究发表于《科学》(Science)。

跳跃基因

借助参与犬衰老计划(Dog Aging Project)的 864 只狗的数据,一支科学家团队绘制了全基因组范围的 DNA 甲基化图谱。DNA 甲基化是表观基因组的一部分,它在不改变每个基因 DNA 序列的前提下影响基因被开启或关闭的程度。表观基因组也会响应饮食或压力等环境线索。对这项研究至关重要的一点是,DNA 甲基化是衰老与 DNA 调控的成熟化学路标。

他们的发现显示,衰老和随时间推移这些调控标记的大范围流失有关,特别是在基因组中被称为跳跃基因或转座元件的区域。一类叫做 LINE1 的跳跃基因被认定为生物衰老差异的关键成分。

LINE1 可以在基因组各处自我复制并插入,从一个染色体跳到另一个染色体,并在过程中损伤 DNA。尽管它们通常受到 DNA 甲基化的约束,但这些调控标记一旦流失,其活性就会上升,这一过程与基因组不稳定、癌症及其他年龄相关疾病有关联。

Snyder-Mackler 说,他们发现转座元件、尤其是 LINE1 的表观遗传调控,似乎是塑造不同狗衰老速度的一个主要因素。

研究发现,基因组中与 LINE1 关联的区域中,超过 40% 会随年龄失去甲基化,这使它成为受影响最大的一类转座元件。这种流失在狗之间分布并不均:大型犬种下降明显更快。

平均而言,巨型犬种每年比小型犬种多失去约 35% 的 LINE1 甲基化。

另一位合著者、同样任职于 ASU 生命科学学院与演化与医学中心的研究员 Blaise Mariner 说,这是他们见过的与犬类广为人知的体型和寿命相互制约的关系最吻合的分子特征之一。这表明大型犬衰老更快,至少部分源于对这些跳跃基因的控制减弱。

性与衰老

研究还揭示出雌性(含两条 X 染色体,即 XX)和雄性(XY)之间一个出乎意料的差异:X 染色体上的 LINE1 在雄性中比雌性甲基化程度更高。这提示雌性可能经历这些元件的更高活性,从而可能影响性别特异性的衰老模式。

在 ASU 生命科学学院与演化与医学中心攻读博士期间共同领导这项工作的 Brianah McCoy 说,这是一个出乎意料的结果,它挑战了他们关于 X 染色体如何被调控的一些假设,也说明表观遗传衰老的复杂。

除具体发现之外,这项研究强调了表观遗传学在塑造健康与长寿方面的重要性。虽然基因序列大体固定,但表观遗传标记会随时间与环境因素变化,为理解衰老生物学提供了一个有效的视角。

这项研究也是同类中规模最大的之一。为分析 864 只狗的基因组,团队必须在一大群多样性的犬只中绘制并测序 300 多万个甲基化位点。只有经过这一浩大工程,团队才能检测到在较小数据集中看不到的模式。

Snyder-Mackler 说,像犬衰老计划这样的大型协作努力对于揭示这类认识很关键。它们让人把分子变化与健康、寿命的现实差异联系起来。

狗的伴侣

最终,这些发现的意义可能超出狗本身,延伸到它们的人类伴侣。

Snyder-Mackler 说,他们的工作提示,转座元件可能是哺乳动物衰老过程的一个基本组成部分。如果确实如此,靶向这些元件或调控它们的机制,可能成为未来开发延长人类健康寿命疗法的一条有前景的路径。

尽管仍需更多研究来确定 LINE1 活性究竟是衰老的因还是果,该研究提供了有力证据,表明这些基因组区域的表观遗传变化是生物衰老的标志,也是其变异性的一个潜在驱动因素。

随着科学家持续揭示衰老的分子机制,有一点愈发清晰:更长寿、更健康生活的秘密,可能就藏在他们基因的调控方式随时间的变化里,而不只是基因本身。

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